Brotten ha begåtts under 2011 och 2012, under den tid då mannen var anställd vid landstinget.
Mannen står åtalad för grov trolöshet mot huvudman, medan kvinnan åtalas för grov medhjälp till trolöshet mot huvudman.
Enligt åtalet gjordes fem utbetalningar från landstinget till kvinnans företag efter att kvinnan hade skickat falska fakturor. Fakturorna attesterades av mannen och totalt betalades 954 000 kronor ut till kvinnans företag.
Åklagaren har bland annat förhör med anställda på landstinget och värdering av det som skulle ha levererats enligt de osanna fakturorna.