Det kan jämföras med vinsten på 30,6 miljoner kronor under motsvarande kvartal ett år tidigare.
Nettoomsättningen föll drygt 10 procent till 299 miljoner kronor, medan orderingången rusade uppåt till 612 miljoner, från 239 miljoner ett år tidigare.
"För räkenskapsåret som helhet förväntar vi oss fortsatt en kraftig tyngd på leveranser och driftsättningar hos kunder under vårt fjärde kvartal (februari-april) när restriktionerna förhoppningsvis har lättat något", skriver vd Torbjörn Kronander.
Han tillägger att osäkerheten är större än normalt och att pandemin också kan leda till att försäljning, projekt och leveranser förskjuts ytterligare.
Sectra tillhör hittills i år vinnarna på Stockholmsbörsen, med ett kurslyft på över 50 procent.