Anledningen är att supportrar ska ha riktat en laserpenna mot målvakten Kasper Schmeichels ögon när Harry Kane skulle slå den matchavgörande straffen på Wembley.
Dansken räddade straffen, men lämnade en retur som Kane kunde slå in till 2–1, vilket blev slutresultatet.
Uefa meddelar även att de startat en utredning mot England gällande att supportrar ska ha smällt av fyrverkerier samt för störningar under en nationalsång.