Enligt polisen ska ingen vara skadad i branden.
– Det är en fullt utvecklad brand med stora lågor. Vi är på plats och bistår räddningstjänsten, säger polisens presstalesperson Angelica Forsberg och tillägger att det är för tidigt att säga vad som ligger bakom branden.
– Det är en pågående räddningsinsats. Eventuella misstankar eller vad det kan bli i slutändan det har jag ingen aning om i detta nu. Det får utredningen visa längre fram.
Enligt företrädare för moskén är branden resultatet av en attack mot församlingen. Till P4 Sörmland säger moskéns kommunikatör Anas Deneche att familjen som bor i anslutning till moskén tagit emot hot och fysiska attacker under mer än ett års tid vilket lett till flera polisanmälningar.
När räddningstjänsten kom till platsen var det en fullt utvecklad brand i Eskilstunas största moské som ligger på Årbygatan. Rökutvecklingen är omfattande och lågorna slår ut från taket, säger Anders Sessler, vakthavande befäl räddningstjänsten.
Räddningsledarna har bedömt att huvudbyggnaden inte går att rädda då elden har tagit sig igenom taket, säger han.
– Just nu är fokus att försöka rädda de två tillbyggnader som finns i anslutning till huvudbyggnaden.
En förundersökning om mordbrand har inletts, skriver polisen på sin hemsida.